校医院是集医疗、科研、预防为一体的、按三级甲等医院管理的综合性医院，是全国高校保健医学学会副理事长单位，浙江省高校保健医学学会理事长单位。校医院的本部设在玉泉校区，下设紫金港校区分院、西溪校区分院、华家池校区分院及求是社区卫生服务站、紫金文苑卫生服务站等医疗分支机构。是省市医保的定点医疗单位，实施对外开放服务。 

医院现有职工358名，其中卫技人员290人，具有高级职称的医务人员58名，有床位180张，开设了急诊科、普内科、心血管内科、消化内科、呼吸内科、神经内科、感染科、儿科、普外科、妇科、骨科、肛肠科、皮肤科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、中医科、理疗科等18个临床医疗科室；并有药剂科、检验科、放射科、特检科（包括B超室、心电图室、胃肠镜室）等4个医技科室。近年来，医院先后配置了16排螺旋CT、直接数字化放射成像设备（DR）、计算机化X线放射影像系统（CR）、日立7180全自动生化分析仪、贝克曼血球计数仪、西门子彩超、奥林巴斯电子胃镜、电子肠镜、动态心电图机、动态血压仪、腹腔镜、关节镜等先进的医疗设备，今年又配备了DR数字流动体检车，不断提升医院的诊疗水平。 

校医院业务水平不断提高，被群众誉为“放心医院”。医院每年接待门诊病人60余万人次，开展各类手术上千例。其中包括腹腔镜、关节镜等微创手术。还可施行胆囊摘除术、甲状腺次全切、胃肿瘤切除、骨折内固定等各类手术。浙一、浙二、邵逸夫等医院的10多位著名专家定期到我院进行专家门诊、专家查房和手术指导，提升了我院诊治疑难重症的技术。 

校医院在体检工作中经验丰富，优势明显，已成为在杭高校的体检中心。每年为本校和其他在杭高校的教师、学生及周边居民进行体检几十万人次，是各单位健康体检的首选医院。